Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm3099J3QPA5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm3099J3QPA5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms