Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm3415J3QMS8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm3415J3QMS8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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