Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm6268A2A3U9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gm6268A2A3U9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6268A2A3U9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6268A2A3U9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6268A2A3U9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6268A2A3U9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6268A2A3U9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm6268A2A3U9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms