Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCML2Q9UQR0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCML2Q9UQR0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms