Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBE1Q9UJT0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBE1Q9UJT0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms