Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MBD1Q9UIS9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD1Q9UIS9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms