Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHD7Q9P2D1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHD7Q9P2D1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms