Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HMG20BQ9P0W2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMG20BQ9P0W2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms