Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DNAJC28Q9NX36 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DNAJC28Q9NX36 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms