Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TREX1Q9NSU2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TREX1Q9NSU2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms