Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPMQ9NSP4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPMQ9NSP4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms