Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM7SF3Q9NS93 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM7SF3Q9NS93 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms