Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTA1Q9NP79 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VTA1Q9NP79 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms