Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hip1rQ9JKY5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hip1rQ9JKY5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms