Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E9

BRD8, Bromodomain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD8Q9H0E9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
BRD8Q9H0E9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRD8Q9H0E9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD8Q9H0E9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD8Q9H0E9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD8Q9H0E9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD8Q9H0E9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD8Q9H0E9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD8Q9H0E9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD8Q9H0E9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD8Q9H0E9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD8Q9H0E9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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