Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc83Q9D4V3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc83Q9D4V3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms