Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc167Q9D162 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc167Q9D162 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms