Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mis12Q9CY25 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mis12Q9CY25 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms