Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SDF4Q9BRK5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDF4Q9BRK5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms