Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
KarsQ99MN1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KarsQ99MN1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KarsQ99MN1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms