Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SIN3AQ96ST3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SIN3AQ96ST3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms