Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HHIPQ96QV1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HHIPQ96QV1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms