Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BICD1Q96G01 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BICD1Q96G01 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms