Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NKD1Q969G9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NKD1Q969G9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms