Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRF1Q92994 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRF1Q92994 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms