Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCC1Q92922 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCC1Q92922 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCC1Q92922 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMARCC1Q92922 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMARCC1Q92922 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms