Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nrif1Q923B3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nrif1Q923B3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms