Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRN4Q8WUT4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRN4Q8WUT4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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