Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LcorQ6ZPI3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LcorQ6ZPI3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms