Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUX4L9Q6RFH8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUX4L9Q6RFH8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms