Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM259Q4ZIN3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM259Q4ZIN3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms