Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrfip1Q3UZ39 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrfip1Q3UZ39 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms