Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrch2Q3UMG5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lrch2Q3UMG5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms