Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA3Q16787 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA3Q16787 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LAMA3Q16787 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
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