Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEMA3AQ14563 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA3AQ14563 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA3AQ14563 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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