Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MSLNQ13421 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSLNQ13421 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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