Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGDRQ13258 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGDRQ13258 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGDRQ13258 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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