Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRJQ12913 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRJQ12913 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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