Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 URK1YNR012W 1506 nt3.9□□□□□ -1.78
HER1Q12276 RXT3YDL076C 885 nt3.9□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YGR064WYGR064W 369 nt3.9□□□□□ -1.79
HER1Q12276 ERV29YGR284C 933 nt3.9□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YHR173CYHR173C 339 nt3.9□□□□□ -1.79
HER1Q12276 SVP26YHR181W 687 nt3.9□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YML047W-AYML047W-A 366 nt3.9□□□□□ -1.79
HER1Q12276 SYC1YOR179C 567 nt3.9□□□□□ -1.79
HER1Q12276 TAF14YPL129W 735 nt3.9□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YPR059CYPR059C 387 nt3.9□□□□□ -1.79
HER1Q12276 VPS38YLR360W 1320 nt3.9□□□□□ -1.79
HER1Q12276 RPB2YOR151C 3675 nt3.9□□□□□ -1.79
HER1Q12276 KIP3YGL216W 2418 nt3.9□□□□□ -1.79
HER1Q12276 TAF6YGL112C 1551 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 CTK1YKL139W 1587 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 LYP1YNL268W 1836 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 SPT23YKL020C 3249 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 RPL13AYDL082W 600 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 UBC8YEL012W 657 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 MMF1YIL051C 438 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 ARC15YIL062C 465 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 SDS22YKL193C 1017 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 NKP2YLR315W 462 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 SGT1YOR057W 1188 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YGL176CYGL176C 1665 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 RPO31YOR116C 4383 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 UBP12YJL197W 3765 nt3.89□□□□□ -1.79
HER1Q12276 SLI1YGR212W 1407 nt3.88□□□□□ -1.79
HER1Q12276 MNL1YHR204W 2391 nt3.88□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YCR108CYCR108C 192 nt3.88□□□□□ -1.79
HER1Q12276 AUR1YKL004W 1206 nt3.88□□□□□ -1.79
HER1Q12276 SEC14YMR079W 915 nt3.88□□□□□ -1.79
HER1Q12276 FMP41YNL168C 780 nt3.88□□□□□ -1.79
HER1Q12276 BUD21YOR078W 645 nt3.88□□□□□ -1.79
HER1Q12276 DDP1YOR163W 567 nt3.88□□□□□ -1.79
HER1Q12276 GAL7YBR018C 1101 nt3.88□□□□□ -1.79
HER1Q12276 CUP9YPL177C 921 nt3.88□□□□□ -1.79
HER1Q12276 ACE2YLR131C 2313 nt3.88□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YKL050CYKL050C 2769 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 CHL1YPL008W 2586 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YRM1YOR172W 2361 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 UBC9YDL064W 474 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 GRX3YDR098C 858 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 LSM4YER112W 564 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 COG2YGR120C 789 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 IKI1YHR187W 930 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 APQ13YJL075C 417 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 BUD19YJL188C 309 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YLR444CYLR444C 303 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YMR187CYMR187C 1296 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 MPP6YNR024W 561 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 OXR1YPL196W 822 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 MRPL27YBR282W 441 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 BI3Q0115 1554 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 GRS2YPR081C 1857 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 NAT1YDL040C 2565 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 EMC1YCL045C 2283 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 VID27YNL212W 2349 nt3.87□□□□□ -1.79
HER1Q12276 ISW2YOR304W 3363 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YCR007CYCR007C 720 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YAP6YDR259C 1152 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 SCM4YGR049W 564 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YGR115CYGR115C 780 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YJL147CYJL147C 1149 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 SSO2YMR183C 888 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 RRG7YOR305W 729 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YBR071WYBR071W 636 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 TRS20YBR254C 528 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 ERG9YHR190W 1335 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 SEG1YMR086W 2883 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 FOX2YKR009C 2703 nt3.86□□□□□ -1.79
HER1Q12276 NUP85YJR042W 2235 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 TAF7YMR227C 1773 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 ELO2YCR034W 1044 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 RPC11YDR045C 333 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 RPS13YDR064W 456 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 MTC7YEL033W 420 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YER076CYER076C 909 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YGL152CYGL152C 678 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 MIC26YGR235C 702 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 REE1YJL217W 597 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 CNB1YKL190W 528 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 MCM1YMR043W 861 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 TUM1YOR251C 915 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 RSA1YPL193W 1146 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 OPY1YBR129C 987 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 POP7YBR167C 423 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 RIB5YBR256C 717 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 BCS1YDR375C 1371 nt3.85□□□□□ -1.79
HER1Q12276 FLO8YER109C 2400 nt3.84□□□□□ -1.79
HER1Q12276 GTR2YGR163W 1026 nt3.84□□□□□ -1.79
HER1Q12276 GCD14YJL125C 1152 nt3.84□□□□□ -1.79
HER1Q12276 SOP4YJL192C 705 nt3.84□□□□□ -1.79
HER1Q12276 FMP46YKR049C 402 nt3.84□□□□□ -1.79
HER1Q12276 IDP2YLR174W 1239 nt3.84□□□□□ -1.79
HER1Q12276 DLT1YMR126C 1029 nt3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57 ms