Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Sox8Q04886 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sox8Q04886 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms