Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAP1Q03518 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TAP1Q03518 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TAP1Q03518 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms