Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RPL23P62829 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RPL23P62829 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL23P62829 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL23P62829 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL23P62829 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL23P62829 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL23P62829 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL23P62829 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL23P62829 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RPL23P62829 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RPL23P62829 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL23P62829 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms