Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CgnP59242 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CgnP59242 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CgnP59242 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CgnP59242 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CgnP59242 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CgnP59242 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CgnP59242 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CgnP59242 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CgnP59242 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CgnP59242 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CgnP59242 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CgnP59242 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CgnP59242 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CgnP59242 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CgnP59242 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CgnP59242 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CgnP59242 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CgnP59242 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CgnP59242 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CgnP59242 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CgnP59242 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms