Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup43P59235 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup43P59235 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nup43P59235 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup43P59235 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup43P59235 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms