Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdhaP50136 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdhaP50136 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms