Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptpn1P35821 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptpn1P35821 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 370.3 ms