Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TpoP35419 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TpoP35419 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TpoP35419 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TpoP35419 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TpoP35419 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TpoP35419 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TpoP35419 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TpoP35419 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TpoP35419 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TpoP35419 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TpoP35419 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TpoP35419 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TpoP35419 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TpoP35419 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TpoP35419 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TpoP35419 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TpoP35419 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TpoP35419 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TpoP35419 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TpoP35419 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TpoP35419 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TpoP35419 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TpoP35419 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TpoP35419 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TpoP35419 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TpoP35419 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TpoP35419 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TpoP35419 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TpoP35419 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TpoP35419 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TpoP35419 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TpoP35419 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TpoP35419 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TpoP35419 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TpoP35419 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TpoP35419 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TpoP35419 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TpoP35419 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TpoP35419 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms