Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp3P28862 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp3P28862 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp3P28862 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp3P28862 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp3P28862 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp3P28862 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp3P28862 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp3P28862 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms