Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPRMP28827 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
PTPRMP28827 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPRMP28827 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
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