Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxd9P28357 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms